Lietuvos mokyklų bibliotekos yra Švietimo, mokslo ir sporto ministerijos pavaldumo srityje, tačiau įstatymus ir teisės aktus, reglamentuojančius bibliotekų veiklą, rengia ir jų įgyvendinimą prižiūri Kultūros ministerija. Aukščiausio lygio aktas skirtas bibliotekų darbui Lietuvoje yra Bibliotekų įstatymas. Pagal jį mokyklų bibliotekos yra Lietuvos bibliotekų sistemos dalis, mokyklos struktūrinis padalinys, kuriame aptarnaujama mokyklos bendruomenė. Mokyklų bibliotekos finansuojamos iš valstybės biudžeto per ŠMSM ir savivaldybių biudžetus.
